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冷冻离心机的工作原理主要分两部分，即离心部分和冷冻部分。主要包括驱动电机、驱动电路、显示器、压缩机组、钢制机架、电子门锁、合金转子体等部件构成。通过程序的设置能实现离心转数可调，离心时间可设定，离心温度可控制三个较基本的要素。冷冻离心机可分为超高或高速冷冻离心机和低速冷冻离心机，其应用的领域和实验范围又有区别。低速冷冻离心机转速普通不超越10000rpm，较大容量为12L，在实验室中较常用于大量初级分离你，可分别提取生物大分子、沉淀物等。其转头多用铝合金制的甩平式和角式两种，离心管有硬质玻璃、聚乙烯硬塑料和不锈钢管多种型号。离心机装配有驱动电机、定时器、调整器（速度指示）和制冷系统（温度可调范围为-20~+40℃），可依据离心物质所需，改换不同容量和不同型号转速的转子体。